Структуру органов местного самоуправления муниципального округа составляют:
представительный орган муниципального образования - Собрание Охинского муниципального округа Сахалинской области Российской Федерации. Краткое наименование – Собрание Охинского муниципального округа;
глава Охинского муниципального округа Сахалинской области Российской Федерации. Краткое наименование – глава Охинского муниципального округа;
исполнительно-распорядительный орган – администрация Охинского муниципального округа Сахалинской области Российской Федерации. Краткое наименование - администрация Охинского муниципального округа;
контрольно-счетный орган - контрольно-счетная палата Охинского муниципального округа Сахалинской области Российской Федерации. Краткое наименование - контрольно-счетная палата Охинского муниципального округа;
иные органы и выборные должностные лица местного самоуправления - финансовое управление Охинского муниципального округа Сахалинской области Российской Федерации. Краткое наименование - финансовое управление Охинского муниципального округа.
Изменение структуры органов местного самоуправления муниципального округа осуществляется не иначе как путем внесения изменений в Устав.
Решение Собрания муниципального округа об изменении структуры органов местного самоуправления муниципального округа вступает в силу не ранее чем по истечении срока полномочий Собрания муниципального округа, принявшего указанное решение, за исключением случаев, предусмотренных Федеральным законом от 06.10.2003 № 131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в Российской Федерации».
Финансовое обеспечение деятельности органов местного самоуправления муниципального округа осуществляется исключительно за счет собственных доходов бюджета муниципального округа.